J'imagine que ce doit être proche entre E46 et E39 vu la proximité de ces générations, et voici comment ça se passe dans ce cas :
Le verrouillage du véhicule en roulant se règle normalement dans le CAR & KEY MEMORY,
mais il est rattaché à CAR et pas à KEY (voir ligne 10 dans l'image ci-dessous). Cela veut dire que le réglage serait indépendant de la clé.
Tu peux modifier ces options en 30min à la concession pour quelques euros, ou gratis s'ils sont sympa.
Les options rattachées à CAR sont des réglages pour la voiture.
Les options rattachées à KEY sont réglables pour chacune des clés de la voiture.
Maintenant à savoir pourquoi l'option se serait désactiver, je ne sais pas.
Si ta fonction est bien rattachée au CAR & KEY MEMORY, je ne pense pas qu'il y ait un fusible par option, et que ton problème viendrait donc de là.
En tout cas voici mon expérience, je ne prétends pas être sûr que ça fonctionne comme ça dans ta voiture.
Voici un exemple des options disponibles et paramétrables facilement (il y en a d'autres encore, tout n'est pas là).
Comme je crois l'avoir dit dans le post de ma voiture, lors de ma dernière révision (il n'y a pas longtemps pour ceux qui suivent

)
ils m'ont laissé rentré dans le leur local pour les regarder trifouiller dans ces options. C'est super facile, il y a juste à cocher des cases, et roule ma poule.
